第 2 どこから始めるか
チャプターリード：ハメッド・アベディタシュ & クリスティン・コストカ
「千里の道も一歩から。」 - 老子
OHDSIコミュニティは、学術界、産業界、政府機関全体で利害関係者のモザイクを表しています。我々の業務は患者、提供者、研究者、および医療システム、産業、政府機関など、さまざまな個人および組織に利益をもたらします。この利益は、医療データ分析の質を向上させるだけでなく、これらの利害関係者にとっての医療データの有用性を向上させることによって達成されます。我々は観察研究が破壊的な思考から大いに恩恵を受ける分野であると信じています。私たちは積極的に新しい方法論的アプローチを探し、奨励しています。 ## 旅に参加しよう OHDSIは、患者、医療専門家、研究者、または私たちの目的を信じる人など、誰でも積極的に参加することを歓迎します。OHDSIは包括的な会員モデルを維持しています。OHDSIのコラボレーターになるために会員費は必要ありません。コラボレーションは、毎年のOHDSI会員カウントに含まれるために手を挙げるだけで簡単にできます。参加は完全に任意です。コラボレーターは、週ごとのコミュニティコールに参加するだけの人から、ネットワーク研究やOHDSI作業グループを率いる人まで、さまざまなレベルの貢献が可能です。データ保持者でなくても、活発なコミュニティメンバーと見なされることができます。OHDSIコミュニティは、データ保持者、研究者、医療提供者、患者および消費者のすべてにサービスを提供することを目的としています。コラボレーターのプロフィールの記録はOHDSIウェブサイトで維持され、定期的に更新されます。会員シップはOHDSIコミュニティコール、作業グループおよび地域のチャプターによって促進されます。
図 2.1: 旅に参加しよう - OHDSIコラボレーターになるには。
2.0.1 OHDSIフォーラム
OHDSIフォーラム3は、OHDSIコミュニティのコラボレーターが投稿メッセージの形で会話を持つことができるオンラインディスカッションサイトです。フォーラムはツリー状のディレクトリ構造を持っています。最上部は「カテゴリ」です。フォーラムは、関連するディスカッションのためにカテゴリに分けることができます。カテゴリの下にはサブフォーラムがあり、これらのサブフォーラムにはさらにサブフォーラムが存在することがあります。トピック（一般的にはスレッドと呼ばれる）は最下層のサブフォーラムの下にあり、これらの場所でフォーラムメンバーがディスカッションや投稿を開始することができます。
OHDSIフォーラムには、次のようなコンテンツのカテゴリがあります：
- 一般: OHDSIコミュニティについての一般的なディスカッションと参加方法について
- 実装者: 共通データモデルおよびOHDSI分析フレームワークをローカル環境に実装する方法についてのディスカッション
- 開発者: OHDSIアプリケーションや他のOMOP CDMを活用するツールのオープンソース開発についてのディスカッション
- 研究者: CDMベースの研究についてのディスカッション、包括的な研究、統計手法およびOHDSI研究ネットワークに関連するその他のトピック
- CDMビルダー: 進行中のCDM開発についてのディスカッション、要件、語彙、および技術的側面
- 語彙ユーザー: 語彙コンテンツに関するディスカッション
- 地域チャプター（例：韓国、中国、ヨーロッパ）: 地元のOMOP実装およびOHDSIコミュニティ活動に関連する地域のディスカッション、ネイティブ言語で
自分のトピックを投稿し始めるには、アカウントにサインアップする必要があります。フォーラムのアカウントを持っている場合は、一般的なトピックの「Welcome to OHDSI! - Please introduce yourself」というスレッドで自己紹介することをお勧めします。返信して、1) 自己紹介と自分の仕事について少し教えてください、2) コミュニティでどのように手伝いたいか教えてください（例：ソフトウェア開発、研究実施、研究論文執筆など）。これでOHDSIの旅が始まります！ここから、ディスカッションに参加することをお勧めします。OHDSIコミュニティは、フォーラムを使って質問し、新しいアイデアを議論し、協力することを奨励しています。
トピックを「ウォッチ」することができます。これは、ウォッチしているトピックに新しい投稿が追加されたときに、メールを受け取り、メールを介して投稿に直接返信できることを意味します。一般的なスレッドをウォッチして、今後の会議のアジェンダ、協力機会の詳細を受け取り、毎週のOHDSIダイジェストを直接受信トレイに届けましょう！
2.0.2 OHDSIイベント
OHDSIは、コラボレーター同士が互いから学び、将来の協力を促進する機会を提供するために、定期的に対面イベントを開催しています。これらのイベントはOHDSIウェブサイトで通知され、参加を希望する人は無料で参加できます。
OHDSIシンポジウムは、米国、ヨーロッパ、アジアで毎年開催される科学会議で、コラボレーターが最新の研究をプレナリートーク、ポスター発表、ソフトウェアデモンストレーションを通じて発表する場です。OHDSIシンポジウムはネットワーキングのための素晴らしい場であり、コミュニティ全体での最新の進展について学ぶ機会です。OHDSIシンポジウムは通常、OHDSIチュートリアルが併設されており、コミュニティの新人がデータ標準や分析ベストプラクティスに関するハンズオン機会を得ることができます。これらのチュートリアルは通常ビデオ録画され、イベント後にOHDSIウェブサイトで公開され、イベントに参加できなかった人も利用できます。
OHDSIコラボレーターの対面イベントは、通常は共有の関心事に焦点を当てる小規模なフォーラムです。過去のイベントには、フェノタイプ・ハッカソン、データ品質ハッカソン、オープンソースソフトウェアのドキュメンテーション・ハッカソンなどが含まれます。OHDSIは、特定の研究課題を解決するために、デザインと観察分析の実行を行ってる多日間のセッションである、複数の研究イベントを開催しました。すべてのこれらのイベントでは、共通の問題を解決するための強い願望と、学びと協力的な問題解決プロセスの継続的な改善に対する共有の関心があります。
OHDSIコミュニティの力についてもっと学びましょう。過去のシンポジウム、対面会議の探索や、OHDSIチュートリアルの視聴は、OHDSIウェブサイトの過去のイベントセクションで行えます。過去のイベントは定期的に更新され、コミュニティイベントがアーカイブされています。
2.0.3 OHDSIコミュニティコール
OHDSIコミュニティコールは、OHDSIコミュニティ内で行われている活動をスポットライトで紹介する毎週の機会です。毎週火曜日の午前11時から正午（ET）の間に行われるこれらのテレカンファレンスは、OHDSIコミュニティ全体が集まり、最近の開発を共有し、個々のコラボレーター、作業グループ、およびコミュニティ全体の成果を認識するための時間です。各週の会議は記録され、発表はOHDSIウェブサイトのリソースにアーカイブされます。
すべてのOHDSIコラボレーターは、この毎週のテレカンファレンスに参加することを歓迎され、コミュニティディスカッションのトピックを提案することを奨励されています。OHDSIコミュニティコールは、研究成果を共有し、進行中の作業に対するフィードバックを求める機会、開発中のオープンソースソフトウェアツールをデモンストレーションする機会、データモデリングと分析のためのコミュニティベストプラクティスを議論する機会、および助成金/出版/会議ワークショップのための将来の協力機会をブレインストーミングする場となるかもしれません。OHDSIコラボレーター会議のためのトピックを持っているコラボレーターは、OHDSIフォーラムで考えを投稿するように招待されます。
OHDSIコミュニティの新規参入者として、このコールシリーズをカレンダーに追加して、OHDSIネットワーク全体で何が起こっているかを知ることをお勧めします。もしOHDSIコールに参加したい場合は、OHDSIフォーラムで発表を確認してください。コミュニティコールのトピックは週ごとに異なります。OHDSIフォーラムのOHDSIウィークリーダイジェストで、毎週のプレゼンテーションのトピックについての詳細情報を確認することもできます。新規参入者は、初回のコールで自己紹介し、コミュニティについて、彼らの背景、そしてOHDSIにどうやって来たのかを話すよう招待されています。
2.0.4 OHDSI作業グループ
OHDSIには、作業グループチームが率いるさまざまな進行中のプロジェクトがあります。各作業グループには、プロジェクトの目的、目標、およびコミュニティに貢献する成果物を決定するリーダーシップチームがあります。作業グループへの参加は、プロジェクトの目的と目標に貢献することに関心があるすべての人に開かれています。作業グループは、長期間の戦略的目的や、コミュニティ内の特定のニーズを達成するための短期プロジェクトである可能性があります。作業グループのミーティング頻度はプロジェクトリーダーシップによって決定され、グループごとに異なることがあります。アクティブな作業グループのリストは、OHDSIWikiに維持されています。
表 2.1 は、アクティブなOHDSI作業グループの簡易リファレンスを提供します。コールに参加して、より多くを学ぶことをお勧めします。
表: (#tab:OHDSIworkgroups) 注目すべきOHDSI作業グループ
| 作業グループ名 | 目的 | 対象オーディエンス |
|---|---|---|
| Atlas & WebAPI | AtlasとWebAPIは、OMOP共通データモデルを基盤にして構築された標準化された分析機能を提供するためのOHDSIオープンソースソフトウェアアーキテクチャの一部です。 | オープンソースのAtlas/WebAPIプラットフォームを改善し、貢献することを目指すJava & JavaScriptソフトウェア開発者 |
| CDM & Vocabulary | 臨床患者データに適用される体系的、標準化された大規模分析のためのOMOP共通データモデルを開発し続ける。標準化された分析をサポートするために、他の作業グループによって開発された分析をサポートするために、国際的なコーディングシステムおよび患者ケアの臨床的側面のカバレッジを増やすことにより、標準化語彙の品質を向上させる。 | OMOP共通データモデルと標準化語彙の改善に関心があり、すべてのニーズとユースケースに対応できる人 |
| Genomics | OMOP CDMを拡張して患者のゲノムデータを取り込む。グループは、様々なシーケンシングプロセスからの遺伝変異の情報を保存できるCDM対応スキーマを定義する。 | すべての人に開放 |
| Population-Level Estimation | 観察研究による科学的方法を開発し、正確で信頼性が高く再現可能な集団レベルの効果推定を提供し、コミュニティでこれらの方法の使用を促進する。 | すべての人に開放 |
| Natural Language Processing | 電子健康記録（EHR）のテキスト情報をOHDSIの傘下での観察研究に利用することを促進する。この目的を達成するため、グループは臨床テキストを利用するための方法とソフトウェアを開発し、OHDSIコミュニティの研究で使用する。 | すべての人に開放 |
| 患者レベル予測 | 正確で良く校正された患者中心の予測モデルを開発する標準化プロセスを確立し、複数の関心のある結果に使用でき、どんな患者サブポピュレーションにも適用できる | すべての人に開放 |
| Gold Standard Phenotype Library | OHDSIコミュニティのメンバーが、コミュニティで検証されたコホート定義を研究やその他の活動のために見つけ、評価し、利用できるようにする | フェノタイプのキュレーションと検証に関心のあるすべての人に開放 |
| FHIR Workgroup | OHDSI FHIR統合のロードマップを確立し、OHDSIベースの観察研究のためにEHRコミュニティ内でFHIR実装とデータを活用するための推奨を提供し、FHIRベースのツールとAPIを通じてOHDSIデータと研究結果を普及させるための推奨を提供する。 | 相互運用性に関心のあるすべての人に開放 |
| GIS | OMOP CDMを拡張し、患者の環境曝露履歴をその臨床フェノタイプと関連付けるためにOHDSIツールを活用する | 健康関連の地理属性に興味のあるすべての人に開放 |
| Clinical Trials | OHDSIプラットフォームとエコシステムが試験のあらゆる側面で助けることができる臨床試験のユースケースを理解し、OHDSIツールの更新を支援してサポートする。 | 臨床試験に興味のあるすべての人に開放 |
| THEMIS | 各OMOPサイトで設計されたETLプロトコルが最高品質で再現可能かつ効率的であることを保証するためにOMOP CDMコンベント以上の標準コンベントを開発すること。 | ETL標準化に関心のあるすべての人に開放 |
| Metadata & Annotations | 観察データセットに関する有用なデータアーティファクトを研究者が消費し作成できるようにするために、共通データモデルに人間および機械によって作成されたメタデータおよび注釈を格納する標準プロセスを定義すること。 | すべての人に開放 |
| Patient Generated Health Data (PGHD) | スマートフォン/アプリ/ウェアラブルデバイスで生成されるPGHDのETLコンベント、臨床データとの統合プロセス、および分析プロセスを開発することを目指す作業グループ。 | すべての人に開放 |
| Women of OHDSI | OHDSIコミュニティ内の女性が集まり、科学技術、工学、数学（STEM）で働く女性として直面する課題を話し合うフォーラムを提供する。女性が自分の視点を共有し、懸念事項を提起し、OHDSIコミュニティがSTEMの女性をいかにサポ |
2.1 どこにフィットするか
今頃あなたは「OHDSIコミュニティに自分はどこにフィットするのか？」と疑問に思っているかもしれません。
私は臨床研究者で研究を始めたいと思っています。 特定の質問に答えるためにOHDSIリサーチネットワークを使用したい臨床研究者であるなら、たとえば論文を発表したいと考えているなら、あなたは正しい場所にいます。アイデアをOHDSIフォーラムのOHDSIリサーチャーズトピックに投稿することから始めましょう。これにより、同じ関心を持つ研究者とつながることができます。OHDSIは論文の発表を愛しており、あなたの研究質問を分析や論文に変換するための多くのリソースを提供しています。詳しくは、Chapter 11、12、13をご覧ください。
私はOHDSIコミュニティが産出する情報を読み消費したいと思っています。 あなたが患者であっても、実践中の臨床医であっても、ヘルスケアの主題専門知識を持っている人であっても、OHDSIは健康結果をよりよく理解するのに役立つ高品質なエビデンスを提供したいと考えています。コードを書くのは久しぶりかもしれません。プログラムを書いたことがないかもしれません。あなたにはこのコミュニティに居場所があります。私たちはあなたをエビデンス消費者と呼びます。あなたはOHDSIの研究を行動に変えつつあります。OHDSIが生成したエビデンス、生成しているエビデンスを知るために選別し、おそらくあなたに関連する質問も提案したいと考えています。ディスカッションに参加していただきたいと思います。OHDSIフォーラムで質問を始めましょう。コミュニティコールに参加し、最新の研究について聞いてください。OHDSIシンポジウムや対面ミーティングに参加してコミュニティと直接交流しましょう。あなたの質問はOHDSIコミュニティの重要な部分です。声を上げて、あなたが探しているエビデンスについてもっと学ばせてください！
私はヘルスケアのリーダーシップの役割で働いています。データ所有者である、またはその代表であるかもしれません。私の組織のためにOMOP CDMとOHDSI分析ツールの有用性を評価しています。 組織の管理者/リーダーとして、あなたはOHDSIについて耳にしており、OMOP CDMがあなたのユースケースにどのように役立つかを知りたがっているかもしれません。OHDSI過去のイベントの資料を確認して研究の本体を確認することから始めるかもしれません。コミュニティコールに参加してただ聞くだけでも構いません。Chapter 7（データ分析ユースケース）が、OMOP CDMとOHDSI分析ツールがどのような種類の研究を可能にするかを理解するのに役立つかもしれません。旅の途中でOHDSIコミュニティがあなたをサポートします。興味のある具体的な分野がある場合は、例を求めて遠慮せず声を上げてください。世界中の200以上の組織がOHDSIで協力しています。コミュニティの価値を示すための多くの成功事例があります。
私はデータベース管理者で、私の機関のデータをOMOP CDMにETL/変換することを考えています。 データを「OMOP」することを選択することは、斬新で価値のある取り組みです。ETLプロセスを開始しようとしている場合、OHDSIコミュニティETLチュートリアルスライドを参照したり、次回のOHDSIシンポジウムに登録したりしてください。THEMIS作業グループのコールに参加し、OHDSIフォーラムで質問に参加することも考えてみてください。OMOP CDMの成功した実装を支援することに興味を持っているコミュニティの知識が豊富です。恥ずかしがらずに！
私はバイオ統計学者であり、OHDSIツールスタックに貢献することに興味があります。 あなたはRに詳しい。また、Gitにコミットする方法を知っています。何よりも、OHDSIメソッドライブラリにあなたの専門知識を持ち込み、これらの方法論をさらに発展させたいと思っています。現行のコミュニティの優先事項についてさらに聞くために、ポピュレーションレベル推定または患者レベル予測作業グループのコールに参加することから始めましょう。OHDSIツールを使用している際に、該当するGitHubリポジトリ（例：SQL Renderパッケージの問題であれば、OHDSI/SqlRenderのGitHubリポジトリに提出します）に問題を報告することもできます。あなたの貢献を歓迎します！
私はソフトウェア開発者で、OHDSIツールスタックを補完するツールを開発することに興味があります。 コミュニティへようこそ！OHDSIのミッションの一環として、私たちのツールはApacheライセンスの下でオープンソースとして管理されています。OHDSIツールスタックを補完するソリューションの開発を歓迎しています。作業グループに参加し、アイデアを提案してください。OHDSIはオープンサイエンスとオープンコラボレーションに強く投資していることを心に留めておいてください。独自のアルゴリズムやソフトウェアソリューションは歓迎されますが、私たちのソフトウェア開発の主な焦点ではありません。
私はコンサルタントであり、OHDSIコミュニティに助言したいと考えています。 コミュニティへようこそ！あなたの専門知識は貴重であり、感謝されています。適切な場合には、OHDSIフォーラムでサービスを宣伝することができます。OHDSIチュートリアルに参加し、年間を通じてシンポジウムの講演やOHDSIの対面ミーティングで専門知識を共有することを検討してください。
私は学生であり、OHDSIについてもっと学びたいと思っています。 あなたは正しい場所にいます！OHDSIコミュニティコールに参加し、自己紹介を考えてみてください。OHDSIチュートリアルに深入りし、OHDSIシンポジウムや対面ミーティングに参加してOHDSIコミュニティが提供する方法とツールについてさらに学ぶことをお勧めします。特定の研究関心がある場合は、OHDSIフォーラムのリサーチャートピックに投稿して教えてください。多くの組織がOHDSIが支援する研究の機会を提供しています（例：ポストドック、研究フェローシップ）。OHDSIフォーラムにはこれらの機会に関する最新情報が掲載されています。